تمنح الكلية درجة الماجستير في الشريعة الإسلامية في التخصصات الآتية: -التفسير وعلوم القرآن الكريم-الحديث النبوي الشريف وعلومه -العقائد والأديان-الفقه وأصوله -الفقه وأصوله أصول الفقه-الفقه وأصوله الفقه المقارن -الفقه وأصوله فقه المعاملات المالية والمصرفية الإسلامية-الفقه وأصوله فقه الأحوال الشخصية -الفقه وأصوله الشريعة والقانون-الفقه وأصوله الدراسات الوقفية -الفقه وأصوله الفقه الجنائي المقارن-السياسة الشرعية ، فقه القضية الفلسطينية