6 années de résidanat dont 2 années dans le Tronc Commun de Médecine, 2 années au Liban et 2 années à l'étranger. Ce programme vise à former des médecins spécialisés dans les maladies du tube digestif, du foie, des voies biliaires et du pancréas. Le ou la gastroentérologue doit être capable d’agir à titre de consultant en milieu hospitalier ou en cabinet privé et doit pouvoir prendre en charge les patients atteints de maladies digestives en milieu hospitalier ou en consultation externe. Le résident et la résidente doit acquérir les compétences nécessaires au diagnostic, au traitement (médical et endoscopique) et à la prévention des maladies digestives. La formation comprend des stages en gastroentérologie générale ainsi que de nombreux autres spécialisés en nutrition, endoscopie avancée, neurogastroentérologie, hépatologie, radiologie, pathologie, oncologie digestive.